Размещение камней в альпинарии – самая ответственная работа. Прежде, чем камни класть в грунт, их необходимо разложить на земле, тщательно осмотреть, выбрать наиболее интересное положение камня. На места, отведенные под камни, следует уложить небольшие куски полиэтиленовой пленки с проделанными в ней отверстиями для стока воды. Пленка предотвратит рост сорняков.

Из имеющихся камней выбирают один крупный камень с привлекательной поверхностью – он станет основным в нижнем ряду камней. Для камня выкапывают углубление в земле, немного большее по размеру, чем основание камня, затем с помощью лома укладывают в ямку камень. Под основание камня подсыпают щебень и почву. Позади камня также подсыпают почву и тщательно ее утрамбовывают. Камень не должен раскачиваться. 

Не стоит все камни укладывать одинаково – некоторые нужно сгруппировать поплотнее, между другими можно оставить широкие промежутки. Промежутки между камнями засыпаются землей и затем туда высаживаются растения. После того, как выложен первый ряд камней, приступают к укладке второго ряда и продолжают их укладывать ряд за рядом до тех пор, пока не будет построен запланированный альпинарий. Менее крупные камни следует укладывать ближе к границам альпинария.

Затем карманы, щели, промежутки между камнями заполняются землей, она уплотняется и в нее высаживаются растения. Пространства между камнями должно быть достаточно для роста растений.